香港保安局局长李家超3月2日在立法会保安事务委员会会议上表示，皇岗新口岸日后将沿用目前深圳湾口岸的“一地两检”通关模式，特区政府将会在新皇岗口岸大楼内设立港方口岸区，并行使全面司法管辖权，以香港特区法律办理清关、出入境及检疫检查。

皇岗口岸╱落马洲管制站是深港两地之间最繁忙的陆路口岸之一，在疫情之前也是深港之间唯一24小时运作的口岸。但李家超坦言，该口岸已营运超过40年，部分设施已老化，两地的旅检大楼并非直接相连，旅客需转乘接驳巴士往来两个口岸。

深圳市政府在2019年提出在原址重建皇岗口岸的计划，并且建议在新口岸实施“一地两检”，为此，两地政府成立了一个领导小组，由深圳市常务副市长及香港保安局局长共同主持，以深化有关讨论。

同时，香港特区行政长官林郑月娥此前在《施政报告》中提及，将和深圳市政府研究在新皇岗口岸采用“一地两检”安排，释放香港落马洲管制站超过20公顷土地作其他用途。

李家超指出，皇岗口岸大楼改建后，港方口岸区面积将由14万平方米增至40万平方米，香港将有全面司法管辖权，负责清关、出入境、检疫等，预计客流量会由每日6.8万人次增至约10万人次，但货运通关服务会取消，并分流至莲塘香园围口岸，配合货运“东进东出、西进西出”的优化格局。

他透露，口岸大楼的设计和建造工程将由深圳一方承办商负责，主体工程预计2023年底完成，如果出现超支，费用也由深圳方面承担，港府将向深圳支付每年1000元象征式租金。

李家超表示，在新口岸接近落成时，两地政府会向全国人大常委会提请批准实施“一地两检”，港府也会就此进行本地立法工作。特区政府将会在3月24日在立法会提出不具法律效力的政府议案，听取立法会议员就推动皇岗口岸重建计划及实施“一地两检”的意见，并且希望得到立法会的支持，为特区政府的下一步工作提供坚实的基础。

特区政府消息人士此前透露，落马洲管制站释放的土地或会作科创产业发展用途，皇岗口岸重建后将作为客运用途，新口岸大楼已预留空间接驳港铁北环线，未来港府将研究是否在北环线兴建支线到旅检大楼。此外，据悉深圳政府亦计划重建罗湖口岸，港府亦会与深圳当局研究是否于罗湖实行“一地两检”。

根据深圳市政府公布的资料显示，新皇岗口岸的交通规划引入深广中轴城际轨道、穗莞深城际轨道、地铁20号线及预留港铁北环线支线接入条件，未来皇岗口岸将成为辐射大湾区、面向世界的超级口岸和综合交通枢纽。